MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 4834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015851	CCG	2	6	234705	234710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783862
4502	NC_015851	TCT	2	6	234751	234756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783862
4503	NC_015851	GGC	2	6	234899	234904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783862
4504	NC_015851	GC	3	6	234930	234935	0 %	0 %	50 %	50 %	340783862
4505	NC_015851	GCC	2	6	234947	234952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783862
4506	NC_015851	TTC	2	6	234962	234967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783862
4507	NC_015851	CCA	2	6	234972	234977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783862
4508	NC_015851	TTC	3	9	234998	235006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783862
4509	NC_015851	G	6	6	235043	235048	0 %	0 %	100 %	0 %	340783862
4510	NC_015851	GGC	2	6	235102	235107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783862
4511	NC_015851	TCA	2	6	235109	235114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783862
4512	NC_015851	GTT	2	6	235154	235159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_015851	AAG	2	6	235255	235260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783863
4514	NC_015851	ATT	2	6	235283	235288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783863
4515	NC_015851	ACC	2	6	235298	235303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783863
4516	NC_015851	CGGG	2	8	235316	235323	0 %	0 %	75 %	25 %	340783863
4517	NC_015851	TATAA	2	10	235590	235599	60 %	40 %	0 %	0 %	340783863
4518	NC_015851	A	6	6	235598	235603	100 %	0 %	0 %	0 %	340783863
4519	NC_015851	TTA	2	6	235635	235640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_015851	ATC	2	6	235667	235672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_015851	A	6	6	235700	235705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_015851	CAT	2	6	235739	235744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_015851	AG	3	6	235751	235756	50 %	0 %	50 %	0 %	340783864
4524	NC_015851	GA	3	6	235813	235818	50 %	0 %	50 %	0 %	340783864
4525	NC_015851	G	6	6	235871	235876	0 %	0 %	100 %	0 %	340783864
4526	NC_015851	T	6	6	235970	235975	0 %	100 %	0 %	0 %	340783864
4527	NC_015851	GGC	2	6	235986	235991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783864
4528	NC_015851	ACT	2	6	236001	236006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783864
4529	NC_015851	GGC	2	6	236033	236038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783864
4530	NC_015851	TCGACG	2	12	236098	236109	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340783864
4531	NC_015851	AC	3	6	236125	236130	50 %	0 %	0 %	50 %	340783864
4532	NC_015851	GCT	2	6	236321	236326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783864
4533	NC_015851	GAA	2	6	236328	236333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783864
4534	NC_015851	CCA	2	6	236358	236363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783864
4535	NC_015851	TCTT	2	8	236375	236382	0 %	75 %	0 %	25 %	340783864
4536	NC_015851	GCA	2	6	236394	236399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783864
4537	NC_015851	AG	3	6	236475	236480	50 %	0 %	50 %	0 %	340783864
4538	NC_015851	A	6	6	236484	236489	100 %	0 %	0 %	0 %	340783864
4539	NC_015851	TGC	2	6	236530	236535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783864
4540	NC_015851	GTC	2	6	236597	236602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783864
4541	NC_015851	GCT	2	6	236687	236692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783864
4542	NC_015851	AGC	2	6	236838	236843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783865
4543	NC_015851	AGAA	2	8	236909	236916	75 %	0 %	25 %	0 %	340783865
4544	NC_015851	GAA	2	6	236983	236988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783865
4545	NC_015851	ATAAA	2	10	236990	236999	80 %	20 %	0 %	0 %	340783865
4546	NC_015851	ATG	2	6	237001	237006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783865
4547	NC_015851	CGT	2	6	237048	237053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783865
4548	NC_015851	A	7	7	237064	237070	100 %	0 %	0 %	0 %	340783865
4549	NC_015851	AAT	2	6	237162	237167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783865
4550	NC_015851	A	6	6	237221	237226	100 %	0 %	0 %	0 %	340783865
4551	NC_015851	ATG	2	6	237239	237244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783865
4552	NC_015851	ACG	2	6	237325	237330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783865
4553	NC_015851	AAG	2	6	237527	237532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783865
4554	NC_015851	A	6	6	237603	237608	100 %	0 %	0 %	0 %	340783865
4555	NC_015851	AGC	2	6	237714	237719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783865
4556	NC_015851	GTT	2	6	237726	237731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783865
4557	NC_015851	AAG	2	6	237773	237778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783865
4558	NC_015851	GAG	2	6	237784	237789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783865
4559	NC_015851	AACCA	2	10	237794	237803	60 %	0 %	0 %	40 %	340783865
4560	NC_015851	CCA	2	6	237835	237840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_015851	CAG	2	6	237855	237860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_015851	CCG	2	6	237865	237870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_015851	AGT	2	6	237906	237911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_015851	A	6	6	237955	237960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_015851	AAACCC	2	12	238000	238011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_015851	C	8	8	238018	238025	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4567	NC_015851	AGT	2	6	238062	238067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_015851	GAA	2	6	238110	238115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_015851	CAG	2	6	238165	238170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_015851	CCG	2	6	238175	238180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_015851	CTAA	2	8	238209	238216	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_015851	T	6	6	238226	238231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_015851	CACCG	2	10	238256	238265	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4574	NC_015851	AT	3	6	238341	238346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_015851	A	6	6	238371	238376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_015851	TTAA	2	8	238471	238478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_015851	ATTAT	2	10	238496	238505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_015851	TTG	2	6	238537	238542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_015851	TGT	2	6	238561	238566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_015851	AGG	2	6	238635	238640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_015851	AAG	2	6	238656	238661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_015851	AAC	2	6	238782	238787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_015851	T	6	6	238793	238798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_015851	CCT	2	6	238862	238867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783866
4585	NC_015851	GC	3	6	238879	238884	0 %	0 %	50 %	50 %	340783866
4586	NC_015851	GTCC	2	8	238936	238943	0 %	25 %	25 %	50 %	340783866
4587	NC_015851	GCT	2	6	238951	238956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783866
4588	NC_015851	CGC	2	6	239002	239007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783866
4589	NC_015851	GCG	2	6	239047	239052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783866
4590	NC_015851	CCT	2	6	239176	239181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783866
4591	NC_015851	CA	3	6	239226	239231	50 %	0 %	0 %	50 %	340783866
4592	NC_015851	A	6	6	239242	239247	100 %	0 %	0 %	0 %	340783866
4593	NC_015851	ACC	2	6	239315	239320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783866
4594	NC_015851	GC	3	6	239430	239435	0 %	0 %	50 %	50 %	340783866
4595	NC_015851	TCGA	2	8	239487	239494	25 %	25 %	25 %	25 %	340783866
4596	NC_015851	AC	3	6	239600	239605	50 %	0 %	0 %	50 %	340783866
4597	NC_015851	ACC	2	6	239642	239647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783866
4598	NC_015851	AGCGGC	2	12	239667	239678	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340783866
4599	NC_015851	ACG	2	6	239684	239689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783866
4600	NC_015851	CGC	2	6	239694	239699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783866
4601	NC_015851	AGC	2	6	239704	239709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783866
4602	NC_015851	TGC	2	6	239722	239727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783866
4603	NC_015851	GC	3	6	239854	239859	0 %	0 %	50 %	50 %	340783866
4604	NC_015851	CGC	2	6	239893	239898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783866
4605	NC_015851	GAC	2	6	239908	239913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783866
4606	NC_015851	ACC	2	6	239990	239995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_015851	CCG	2	6	240014	240019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_015851	GA	3	6	240059	240064	50 %	0 %	50 %	0 %	340783867
4609	NC_015851	CGAA	3	12	240088	240099	50 %	0 %	25 %	25 %	340783867
4610	NC_015851	CG	4	8	240128	240135	0 %	0 %	50 %	50 %	340783867
4611	NC_015851	CAT	2	6	240155	240160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783867
4612	NC_015851	GGCCG	2	10	240165	240174	0 %	0 %	60 %	40 %	340783867
4613	NC_015851	GCC	2	6	240228	240233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783867
4614	NC_015851	GCG	2	6	240320	240325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783867
4615	NC_015851	CAA	2	6	240377	240382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783867
4616	NC_015851	TCG	2	6	240487	240492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783867
4617	NC_015851	GCT	2	6	240638	240643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783867
4618	NC_015851	CAT	2	6	240668	240673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783867
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4620	NC_015851	TGG	2	6	240736	240741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783867
4621	NC_015851	CAGTAC	2	12	240753	240764	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340783867
4622	NC_015851	CAG	2	6	240858	240863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783867
4623	NC_015851	CGA	2	6	240914	240919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783867
4624	NC_015851	CGT	2	6	240990	240995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783867
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4626	NC_015851	GAA	2	6	241073	241078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783867
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4635	NC_015851	T	6	6	241650	241655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4751	NC_015851	AGG	2	6	247884	247889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783877
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4754	NC_015851	GCGA	2	8	247986	247993	25 %	0 %	50 %	25 %	340783877
4755	NC_015851	GCC	2	6	247997	248002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783877
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4782	NC_015851	CTC	2	6	249373	249378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4783	NC_015851	CAG	2	6	249433	249438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4833	NC_015851	GCG	2	6	251620	251625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783880
4834	NC_015851	ATC	2	6	251651	251656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783880

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